Επιλογές από τα παλιά και σπάνια, ελληνικά και ξένα, βιβλία του μουσείου, που έχουν συντηρηθεί και μελετηθεί, τόσο προς το περιεχόμενο, όσο προς το τεχνικό και αισθητικό κομμάτι τους: η χειρόγραφη ποιητική συλλογή σε γλώσσα Φαρσί του 18ου αιώνα, το Κοράνι που εκτιμάται πριν το 1800, εκδόσεις και εφημερίδες διεθνείς και Κρητικές με ιστορικά γεγονότα, γραμματόσημα κ.ά.
Παρουσιάζονται επίσης δυο τόμοι-άτλαντες του 1887, από το φιλέλληνα Πετρώφ, ο "Άτλας της Μεγαλονήσου Κρήτης" και ο "Άτλας του υπέρ ανεξαρτησίας Ιερού των Ελλήνων Αγώνος (1821-1828).
Παράλληλα εκτίθεται η έκδοση "Διατάγματα" του Γρηγορίου ΙΧ, τυπωμένη στη Λυών της Γαλλίας, το 16ο αιώνα, δωρεά του Ολλανδού συνεργάτη και παλιού τυπογράφου Κορνήλιου Σενκ, καθώς και έκδοση του 17ου αιώνα από τον Τζοβάννι Μπατίστα Τζιράλντι, που πιστεύεται ότι ήταν η πηγή έμπνευσης για τον Σαίξπηρ, για τα έργα του "Οθέλος" και "Με το ίδιο Μέτρο", δωρεά από την Εφορεία Αρχαιοτήτων Χανίων.
